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Line: 161
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Line: 242
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File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/controllers/Equipe.php
Line: 51
Function: groups_members
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/controllers/Equipe.php
Line: 79
Function: equipe
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/controllers/Equipe.php
Line: 41
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File: /var/www/html/apps/ci2/ci/litislab.php
Line: 334
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Filename: libraries/Ldap3.php
Line Number: 162
Backtrace:
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/libraries/Ldap3.php
Line: 162
Function: ldap_get_entries
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/libraries/Ldap3.php
Line: 242
Function: extractGroups
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/controllers/Equipe.php
Line: 51
Function: groups_members
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/controllers/Equipe.php
Line: 79
Function: equipe
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/controllers/Equipe.php
Line: 41
Function: stats
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/litislab.php
Line: 334
Function: require_once
A PHP Error was encountered
Severity: Warning
Message: Invalid argument supplied for foreach()
Filename: libraries/Ldap3.php
Line Number: 163
Backtrace:
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/libraries/Ldap3.php
Line: 163
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Line: 242
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File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/controllers/Equipe.php
Line: 51
Function: groups_members
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/controllers/Equipe.php
Line: 79
Function: equipe
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/applications/litislab/controllers/Equipe.php
Line: 41
Function: stats
File: /var/www/html/apps/ci2/ci/litislab.php
Line: 334
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LITISLAB - Laboratoire d'Informatique de traitement de l'information et des systemes
Equipe Traitement de l'information en Biologie Santé
Responsable : Thierry Lecroq
Objectifs
Rechercher, indexer et extraire des informations pertinentes dans : des données biologiques (génomes et expression des génomes) ; des systèmes d’information en santé (terminologies de santé, dossier électronique du patient).
Approche
structures d’indexation (variations de la transformée de Burrows-Wheeler)
alignement d'ontologies
algorithmes de recherche de motifs et de recherche d'information (recherche classique, périodes abéliennes, recherche d'arbres cartésiens) correction de données de séquençage de troisième génération représentation des connaissances (visualisation et classification) l’extraction de connaissances à partir de textes accès sémantique aux données
Applications
Biologie (séquences génomiques) Santé (données textuelles non structurées) Logiciels
miRabel : Prédiction de cibles de microARNHExoSplice : effet des variations sur les sites d'épissagePackage R SMM : Simulation and Estimation of Multi-State Discrete-Time Semi-Markov and Markov Models HG-CoLoR : correction hybride de données de séquençage de troisième générationELECTOR : évaluation des méthodes de correction de données de séquençage de troisième générationCONSENT : auto-correction de données de séquençage de troisième générationanalyse de profil d’expression génique des tumeurs par RT-MLPA (reverse transcriptase multiplex ligation-dependant probe amplification) UMI-VarCal : appel de variants de basse fréquence gérant les UMIUMI-Gen : générateurs de reads avec UMIdsbwt : Efficient pattern matching in degenerate strings with the Burrows-Wheeler transformSMART : String Matching Algorithms Research Tool
Projets en cours
Réseaux d’Intérêts Normands (RIN)
Normandie Digitale Normandie Biomédicale et Chimie
Autres réseaux
Algorithmique du texte
Bioinformatique
Génomique
Statistiques
Recherche d'informations multiterminologiques
Interopérabilité sémantique inter et intra terminologies
Laboratoire LITISLAB
Le Laboratoire d’Informatique, du Traitement de l’Information et des Systèmes (LITIS)
Le LITIS est une unité de recherche dans le domaine des sciences et technologies de l’information en Normandie
Contact
www.litislab.fr
tél. : 02 32 95 50 11
secretariat@litislab.fr
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